Une ressource importante qui permettra l'étude des mécanismes de résistance du néoplasme, l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques et le développement de nouveaux traitements personnalisés
Je suis 128 tumeurs colorectales métastatiques « miniatures »fidèle aux « originaux », dérivé d'échantillons de tissus tumoraux prélevés sur des patients atteints de cancer lors de l'ablation chirurgicale de la tumeur ou lors d'une biopsie, puis cultivés et maintenus en vie en laboratoire. Il s'agit d'une collection d'organoïdes numériquement très importante, capables de refléter l'organisation et les méthodes de différenciation que possède en réalité le tissu d'origine, qui forme XENTURION, un Biobanque du cancer colorectal « science ouverte »c'est-à-dire mis gratuitement à la disposition de la communauté scientifique pour la recherche en oncologie.
Cette ressource importante, qui représente la quasi-totalité de la grande hétérogénéité des tumeurs colorectales, est le résultat des travaux de chercheurs de l'Institut Candiolo – IRCSSdirigé par Livio Trusolino et Andrea Bertotti, chefs du Laboratoire d'oncologie translationnelle de l'IRCCS de Candiolo et professeurs titulaires d'histologie au Département d'oncologie de l'Université de Turin.
Dans une étude récemment publiée dans la revue Nature Communications, des chercheurs de l'IRCCS de Candiolo ont démontré que les 128 tumoroïdes XENTURION maintiennent une large fidélité moléculaire avec les tumeurs des patients respectifs. «Pour le prouver, nous avons mené des analyses « omiques » multidimensionnelles, une série de tests qui nous permettent d'obtenir un large spectre de informations génétiques de la tumeur» explique Elena Grassi, qui a coordonné les analyses moléculaires de la collection.
Et Trusolino d'ajouter : « Contrairement aux biobanques de tumoroïdes actuelles, qui disposent de quelques dizaines d'échantillons, XENTURION parvient à représenter la quasi-totalité de la diversité intertumorale présente chez les patients à l'échelle d'une population. De plus, les tumoroïdes XENTURION ont été générés par des métastases de patients cancéreux ayant subi une longue série de traitements antitumorauxet donc nos modèles préservent dans leur ADN l'histoire clinique de la personne qui nous fait don de l'échantillon de tumeur.
Pour démontrer la fidélité des tumoroïdes aux tumeurs « originelles » des patients, les scientifiques ont utilisé dans leurs modèles un traitement standard du cancer colorectal, l'anticorps ciblant la protéine EGFR, le cetuximab.
«Les tumeurs ont démontré une sensibilité variable au médicament, en cohérence avec les biomarqueurs de réponse clinique – souligne Bertotti -. En pratique, nos modèles reflétaient pleinement la diversité de réponse des tumeurs colorectales chez les patientsdes cas de cancer sensibles à ceux qui ne répondent pas au traitement.
Enfin, les chercheurs mettent leur potentiel à l’épreuve modèles, qui peuvent être manipulés à la fois pharmacologiquement et avec des techniques de génie génétiquequi vous permettent « d'activer et de désactiver » des gènes spécifiques. Ils ont ensuite recherché et identifié les signaux adaptatifs que la tumeur traite pour se défendre de l'agression du médicament et réduire son effet antiprolifératif. «Une fois que nous avons inhibé certains de ces signaux, nous avons augmenté la profondeur de la réponse de la tumeur au cétuximab – commente Simonetta Leto, qui a supervisé la caractérisation biologique des tumoroïdes -. Cela signifie que notre plateforme XENTURION est capable d'ouvrir de nouvelles voies pour la recherche préclinique au niveau moléculaire. »
Le travail des chercheurs ne s’arrête pas là, mais se poursuivra avec la collecte et la validation d’autres tumoroïdes. «En outre, dans les prochains mois, l'IRCCS Candiolo formalisera la transition de XENTURION d'une plateforme expérimentale à une Biobanque, mettant ainsi à la disposition de la communauté scientifique un outil important capable de accélérer le développement de nouveaux traitements pour les patients atteints d'un cancer colorectal avancé et d'autres types de cancer », annonce Anna Sapino, directrice scientifique de l'IRCCS de Candiolo.
Salvatore Nieddu, directeur général de l'IRCSS piémontais, conclut : « Nous avons investi d'énormes ressources pour construire l'infrastructure qui hébergera la Biobanque d'échantillons vitaux de tumeurs. Notre ambition est d'offrir une ressource unique en termes de chiffres, de qualité d'annotation clinique et moléculaire et de fidélité des modèles aux tumeurs originales des patients donneurs.